受在校任教的早期中共党员胡允恭的影响,于1929年参加青年团组织。后因家贫辍学,在家边学中医边种田。1935年,接受地下党员张如屏指派,以帮小甸集方家祥家开中药店为掩护,为家乡的地下党组织收集情报传递信息。1937年9月,孙祝华加入中国共产党。1938年初,参加曹云露、张如屏组建的皖北抗日游击支队,任指导员兼随军医生,转战于寿县、凤阳等地。同年6月,抗日游击支队改编到抗日人民自卫军方和平领导的大队中,组织决定孙祝华留在其家乡杨庙地区发展党组织,先后担任中共河东区委委员、中共杨庙区委书记等职。1940年3月,孙祝华奉命撤退到淮南路东藕塘抗日根据地,后到淮南游击大队任政委。
1942年10月,孙祝华被派回淮西家乡开展抗日游击斗争,建立抗日游击政权。担任寿东南抗日根据地寿四区区委书记,后兼任寿县县委民运部部长。主要活动在今长丰县杨庙、吴山一带。期间,孙祝华在杨庙西南5华里的河豸铺开了一个中药铺,以行医卖药为掩护,走村串户活动在敌人的心脏地带,既为新四军收集了大量重要情报,又为抗日斗争筹集了大批经费。
解放战争时期,孙祝华受寿六合霍中心县委指派,到淮南路东的埠里、造甲一带发展党组织,建立游击队武装,开展敌后斗争,先后担任淮东工委书记、肥北工委书记。1947年增补为中共寿六合霍县委委员并兼任县委组织部长。1949年2月,调任寿合县副县长。
新中国成立后,孙祝华历任皖北直属医院政委、康复医院政委、安徽中医学院副院长等职。1979年离职休养,享受副厅级待遇。1987年4月在合肥病世。
出生地:长丰县杨庙镇